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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

经常作为一个矿业工业原料而被知道的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“排泄窝囊废”称为“宝贝小分子结构”的苦不堪言经历是类似的,到了近10近年才被感觉其更重要的菌物学职能,终究“坐起农奴把演唱”,尤其免疫系统慢性炎症病变性慢性病论述教育领域内熠熠生辉。另一多页论文范文简讯了在各种各样的慢性炎症病变性慢性病的节肢动物模型工具中享有衣康酸或其化学物质掩盖衍菌物的诊治益处,并感觉其潜在性靶点。光于衣康酸的“下一世”与“此生”,具体情况见软文《乳酸的逆袭之哥哥——衣康酸!篇文章和你一起清楚衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应表达核蛋白组学产品,实现1000+高妙度呈现位点检测出,增强显现典型靶点,全方向位置生信介绍解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看到”到“安全验证”全操作流程的服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、研究步奏

02、测量大数据

03、经“点”再现

在场地实测数据信息中,排除诸多文献资料中新闻报导的有趣靶点举例说明衣康酸突显位点,如首个个被察觉到的衣康酸共价突显蛋清酶KEAP1,同时还有糖酵解环路中的3个主要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,或者炎性小体组成的蛋清酶NLRP3和神经细胞死亡步骤中的主要蛋清酶RIPK3等,其质谱图以下的图如下图所示。

04、护肤品特征

1.强有力的加密管控质控

商业服务化特女性朋友探头孵育、SDS-PAGE加测、WB手机验证、模板相关内容性探讨等各位置加测,切实保障大型项目结果显示牢靠性。

2.高耐热性质谱实验室设备网站

在Orbitrap Astral全新几代高判别质谱仪金刚萨垛下,完成衣康硝化作用体现位点及血清司法鉴定新的深度,注力实验探析新察觉到。

3.全标准流程站台式工作

应用场景拜谱菌物建立健全的实验报告游戏平台,可打造“神经细胞塑造培养→查重器孵育→WB查重→高妙度衣康碱化体现查重→特权生信介绍→某位点PRM印证”全工作流程服务项目,省时省劲更好些。

05、剖析內容(一些)

06、运用目标方向

PART 2、文献综述共享

专著一

英文怎么说宝贝标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

简体中文问题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

科研方式:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

学术论文二

因为问题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

中文版主题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

理论研究东西:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、装修案例衍化思维

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13体现了强大的底物紧密联系专业能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物体衣康硝化作用突显组测评数据资料中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应遮盖(以下几点图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人心得体会

算作TCA反复的中的在期间新陈分解物,衣康酸调接新陈分解、免疫细胞系统力和真菌感染当中的共同反响,为缓解免疫细胞系统力真菌感染性消化道重大疾病供给了取代缓解构思。衣康酸框架中的亲电性α,β-不饱和羧酸框架能对核苷酸质上的生物半胱氨酸残基对其进行烷基化体现(迈克尔加持反响),一项英译后体现被可称“衣康酸体现(itaconation)”,而能引响核苷酸质工作,调整免疫细胞系统力回复和新陈分解手段,为多个消化道重大疾病性药物研制开发供给新构思。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化淡化球蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医疗千万参考值靶点产生组(QMT1000)或卡路里基础分泌靶向药物基础分泌组车辆对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参考选取期刊论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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