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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 无线网络临床药理学论述草酸钙肾结石氧化的应激性和疾病问题长效机制

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿软件最应见的疾病症状的一种。肾组织机构中CaOx氯化钠晶体过供大于求积聚会促使肾小管肿瘤细胞神经损伤和凋亡,然后促使肾结石的造成。短链人体皮脂酸由肠胃内厌氧发酵法细茵发酵法伙食弹性纤维产生了,实际上在局部性肠胃天然屏障中表现出来效应,并且在软件关卡上也表现出来重要的效应。在这其中,丁酸是最充实的短链人体皮脂酸,享有抗感染和免疫检测抑制性效应,本探究探究丁酸对CaOx肾结石的效应十分隐性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山诊所泌尿产科吴忠专家教授、周子健研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠博土生导师、周子健博土在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物制品与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网洛药学学服务管理,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

句子明称:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 投资者厂家:华山医院医生 探析目标:大鼠、HK-2生殖细胞 组群消息:比组(Con)、三维模型组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱提高技艺:网络上药剂学学验测

设想的步骤

的研究可是

探讨者第一个搭建大鼠实体建模方法,能够顺利生物化学指数公式和组织机构病症学上色等探讨的手段遇到丁酸会减轻CaOx实体建模方法大鼠肾CaOx尖晶石的建立和神经板材损害,促进CaOx实体建模方法大鼠的炎症病变神经板材损害和腐蚀材质的过分体现。除此以外,丁酸还可治理和改善草酸诱导型的HK-2受损上皮细胞神经板材损害、腐蚀应激性和受损上皮细胞凋亡。 为科学探究丁酸结构的特征和靶人类遗传DNA遗传组wifi在线,探析考生从PubChem添加丁酸和丁酸酯的二维和二维结构的特征(图1A)。可以通过PharmMapper资料库和Uniprot资料库处理后共建立出1115个丁酸靶人类遗传DNA遗传组供进这一步解析。将人类遗传DNA遗传组下拉列表把手机通讯录STRING资料库,进行PPIwifi在线解析。Cytoscape拿出了排顺的前20的联络线站靶人类遗传DNA遗传组的仔细wifi在线图,有CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这部分联络线站人类遗传DNA遗传组与wifi在线中的各种人类遗传DNA遗传组均现象出需的想关于性,解释这部分人类遗传DNA遗传组将更好地发挥出来着融合效应。GO和KEGG解析蕴含了丁酸联络线站人类遗传DNA遗传组的想关于经过和生物技术技术学特点(图1C)。联络线站人类遗传DNA遗传组最基本的与类固醇生长性激素回话、被钝化应激功效性回话、特异性氧细胞系对类固醇生长性激素促进的反馈各种对偏酸生物技术有机物的反馈想关。经验经验,这部分联络线站人类遗传DNA遗传组最基本的参与进来了被钝化应激功效性和对特异性氧的生物技术技术反馈的时候,是肾结石演变成管理机制中至关主要的经过,这认为丁酸将在肾结石中更好地发挥出来主要效应。

图1| 丁酸空间结构与靶人类基因无线网络分享(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一点探究丁酸对CaOx肾结石真的切靶染色体,探究员再生利用GEO大服务器对GSE73680中正常差表与CaOx肾结石病病患的染色体的差异采取了探究。差表组与CaOx结石病病患的关联系数性的差异描述染色体(DEGs)检查标准为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个染色体造成关联系数变,但其中3379个(89.4%)染色体描述调涨,404个(10.6%)染色体描述调低(图2A)。对DEGs采取聚类分析法阐述法阐述,热图提示了前10个被选中DEGs的二维层次聚类分析法阐述法特证(图2B)。接着随后,探究员按照GeneCards大服务器人为司法鉴定了370个可能会与CaOx肾结石关联的染色体,排榜前20位的预计染色体名词解释关联性评价右图2C已知。要为找丁酸控制CaOx肾结石的重要性靶点,探究员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石关联染色体治理 得到了一堆个Venn图。以后,CYP2C9被判别为丁酸关系CaOx肾结石的不确定靶点(图2D)。不仅,探究员还采取了丁酸与CYP2C9的原子核挂接,CYP2C9的这几个酪氨酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸双方用途,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在合理利用网格药剂学学預测CYP2C9是丁酸影晌CaOx肾结石的靶基因遗传后,分析者还经过上皮人体细胞科学实验查证了CYP2C9可减少草酸诱导型的HK-2上皮人体细胞的ROS能力、感染损害和凋亡。

图2| 而言据库协同分享预计CYP2C9是丁酸功能于CaOx肾结石的靶人类基因

分析最终

本研究分析应当出现 丁酸在身体和里面均能抑止CaOx肾结石模式化的脱色应激性性和发炎损坏,最后的能够 在线药学学需求能够得到丁酸作用CaOx肾结石的潜在的靶点——CYP2C9,最后的能够 细胞系核调查印证CYP2C9在草酸盐促进的HK-2细胞系核ROS水平面、发炎损坏和凋亡。这样出现 认为丁酸几率能够 抑止CYP2C9来抑止CaOx肾结石的脱色应激性性,得到缓解发炎损坏。一种过程中中拜谱微海洋生物供给了在线药学学高新技术管理咨询项目,另外拜谱微海洋生物可提升稳重健全完善的人类基因组学、胆固醇质组学、代谢率组学等几组学产品的及高新技术管理咨询项目,受欢迎呼叫管理咨询! 决定性文献综述:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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