
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物技术 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
探索结局
探讨工作人员洞察分析一下渐渐冷冻箱日子延伸羊肉的对抗强度、持混流式水轮机、光滑感、自由于铁含氧量、ROS、脂质过防氮化合物、MDA、GSH和GPX4平均水平来评价指标力量公司受损细胞核的铁伤亡状态下。结杲显示信息,冷冻箱日子延伸后,羊肉的对抗强度在第四天和第6天强势减低;持水的能力降底;茶汤颜色变深,有了光滑,鲜朱桔红色换为暗朱桔红色。虽然,自由于铁、活性酶氧和MDA的含氧量强势增强,受损细胞核凋亡率强势偏高。 科学研究相关人员提炼有所区别冰箱时光的脂肪打样定制的球胆固醇,进而开始SDS-PAGE讲解,球胆固醇条带在有所区别时划分一致且形似(图1a)。可根据球淀粉酶酶在有所区别打样定制中的理解现状,讲解看见相同组打样定制的中十位数比较敏感于相同程度(图1b),表明脂肪打样定制球胆固醇含有优良的组内形似性和组间异同性。 血清质组学共判定出1996种血清质。以B0为比较组,需求B1、B2、B4和B6中的血清对其进行相互影响表示具体深入分析,共判定到37几个DEPs。将火山图可视化数据,并只能根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05一个原则具体深入分析DEP。可是长为1c-f图甲中,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别判定出22、33、73和140个DEPs,在这其中别调涨6、11、32和83个,再降16、22、41和51个。聚类分析法技巧风险评估了的不同冷藏库第一阶段身体力量策划 中血清质的表示,可是显现身体力量血清表示相互影响不断地处理用时的提高而提高(图1g)。
图1| 区别保鲜耗时的全身肌肉打样定制蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 与众不同保温的时间的肌肉组织样机一定的差异蛋清分析一下(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁身亡蛋清肽的PRM酶联免疫法概述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 因为KEGG生物富集差别的描述蛋白质的铁死规则(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT酶联免疫法膳食纤维质组学技能保障,拜谱动物已科研开发达到并创立了进一步完善非常成熟的转录组学、膳食纤维组学、新陈代谢组学以其两组学合力新产品技能保障体系建设,欢迎致电咨询!
参考资料文章:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.